随着人类基因组工作图谱的绘制完成，科学工作者和一些著名的公司将研究重点转向蛋白质组学。基因组的初步结果显示，人类的基因总数仅有3-4万个，仅为果蝇基因数量的2倍，仅从基因数量上看似乎不能解释人与果蝇之间的差异，因为人类的蛋白质总量远远多于果蝇，问题在于基因转录后的加工和翻译后蛋白质的加工，经过转录后选择性剪接、RNA编辑以及蛋白质翻译后的剪接、修饰等，使蛋白质的数量大大增加。要想对数以百万计的蛋白质进行分析，依靠以前的那种作坊式研究方法远远不能满足要求，必须发展一种快速、高效的蛋白质检测技术，基于这种思路，蛋白质芯片技术在基因芯片研制成功后迅速发展起来。